其实有很多东西想要写，但是还是先挑一些比较重要的说吧。
首先是关於现实与虚幻的关系；影片一开始呈现给我们的背景就是 2035 年病毒已经大规模传播，人类已经被迫转移至地下生活的世界，从此引发了开始时男主角被选中到过收集信息（information）等一系列情节；但是影片中不断穿插出现的女主角和男主角对於虚幻和现实的讨论让我不得不怀疑，这个预先设定好的背景是否也是假的，是否一切都像女主角向院长汇报时所说的那样都存在於我们的想像（they're all in our mind）之中呢？整部影片所叙述的这样的一个故事，是否也只是男主角脑中的一个梦而已呢？更或者，男主角本身也只是计算机模拟的一个程序呢？
影片中许多的场景都可以被一一对应起来，比如说：
未来（2035）——过（1996/1990/1920）
科学家——精神病医院的医生（注意性别和人数）
抓到的蜘蛛标本——从窗沿上抓到的蜘蛛
徵集自愿者（volunteers）——机场徵集志愿者的广播
时间机器——CT/核磁共振记起（注意外形和运作方式）
收集信息时进入的建筑——百货超市（注意出售的物品）
进出地表时的消毒程序——进出精神病医院时的清洗程序
其他还有很多，甚至连那个神秘的声音也可以算是，大家可以自行寻找；说道神秘声音，它称呼男主角为巴比（Babi），这是一个带有宗教色彩的名字，而这个神秘的声音是否暗示这男主角的真实身份？是否男主角在现实的世界中的名字是否就叫做巴比？
然後是关於影片最後一段的一系列情节，这里我们先假设片头 2035 的世界就是现实世界；
影片中男主角多次表露说自己的身份是观察者（observer），而观察者一词意味着你所能做的除了观察和收集信息，
（information）之外不能够改变已经发生的过，也就是说影片中的时空旅行是符合自洽性的理论的；病毒的传播、50 亿人类的死亡都是已经发生并且不可盖面的。这样便可以解释为何男主角只是弄清楚了十二猴子军与病毒之间的关系就获得了特赦，如果科学家们真的想要改变过，完全可以在监狱中多挑选一些自愿者（volunteers）进行旅行，这样要改变过会容易许多；同时也能够解释最後女科学家的出现亦是来收集信息的，她对於自己身份的介绍中所提的保险（in insurance）应当解释为以防万一；而且如果科学家监视到病毒在机场已经被打开，那麽他们完全可以立刻传送男主角回到现在，并重新进行传送（男主角可以保留大部分记忆，如果在现在为他制定好计画，在 1996 年阻止病毒传播简直是轻而易举）。
因此我认为这部影片有很大的可能是在探讨有关於精神病人所面对的真实与虚幻交织的混乱世界和这之中的痛苦（注意男主角面对不同世界转换时的精神状态）。
当然每个人对於同一部电影会有自己独特的见解，我这里所说的也不过是一些胡言乱语罢了。
